直接在NCBI主页输入你要找的基因的名字，比如S1PR1，然后搜索，找到下面的内容： Genes 90Gene: collected information about gene loci 1HomoloGene: homologous gene sets for selected organisms 12UniGene: clusters of expressed transcrip

有时在研究某一基因时需要它的基因序列及其启动子。现在很多已经测序的物种的序列都可以很容易找到。这里以拟南芥某一基因为例，介绍如何利用NCBI查找这些序列。大家赶紧操作试试吧

材料/工具

电脑NCBI官网

首先选择Gene的标签，输入基因名，然后点击搜索，然后出来一大堆基因，选择你的那个物种的基因，点击，进去看一下，选择Mapviewer然后找到序列，选择基因的外显子上游2000bp，下载。。。

方法

首先在360搜索输入可以进入NCBI官网，如图1:

1、在NCBI上查找基因的mRNA序列。 2、Messenger RNA (mRNA）——信使核糖核酸信使核糖核酸 携带遗传信息，在蛋白质合成时充当模板的RNA。信使RNA 从脱氧核糖核酸（DNA）转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸（RNA）。它在核糖体上作为蛋白质

在搜索框中找到“gene”,并输入想要查找的基因号，在这里随便搜一个（at2g11110）,然后“search”；如图2：

搜索答案 我要提问 在NCBI上怎么查找某个启动子元件的序列,比如U6启动子、CMV启动子、EF-1a启动子、H1启动子等等?谢谢首页 问题 全部问题 经济金融 企业

在搜索结果中，找到如下图中的“MapViewer”，查看基因在染色体中的位置；如图3：

首先要了解你所研究物种的启动子序列特征结构，比如TATA框 富含CG的序列等等。然后在NCBI搜索到该物种该基因的上游DNA序列。最后目测！ 果蝇网上有个基于神经网络模型的启动子预测软件：http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter

下一步的结果就能够查看该基因的位置，还有很多其他的信息，且不管它，找到右上角的“Download/View Sequence/Evidence”，进去下载所需的序列；如图4：

一般的来说，在NCBI上查到的基因序列，一般是指的基因的mRNA(cDNA)序列，这个里面，并没有启动子、终止子，增强子这类的信息，你需要通过blast等手段，将染色体上的序列找到，然后使用对应的软件进行分析，从而得到一个初步数据，最终还是需要片

你可以查看到两种形式的序列：FASTA和GenBank，推荐使用后者，因为可以看到对序列的注释，可以清楚的看到哪是基因，哪是启动子，哪是CDS等。而前者只是纯粹的序列。点击“display”查看；如图5：

1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列

由下图可以看出，该基因序列范围：288..2583，mRNA范围：(288..355,444..467,653..935,1032..1135,1253..1375, 1641..1803,2052..2583)，CDS范围：(444..467,653..935,1032..1135,1253..1375,1641..1803, 2052..2188)。基因中的外显子不是连续的，因此CDS也不是连续的；如图6：

一个基因产生多个转录本通常是由一种原因或者几种原因导致，最可能的原因有四种： 1. Alternative splicing 选择性剪接（Alternative splicing）是基因的一种表现方式。生物的基因序列中，包含了内含子（intron）与外显子（exon），两者交互穿插

CDS上游的序列就是该基因启动子部分，而具体的启动子的长度是不一样的，可以根据需要进行选择。如果觉得上游的序列不够长，可以在右上角设定显示的碱基的范围，从而获得足够长度的序列；如图7：

内含子边界并不规则。 AG-GT型内含子的剪接位点 (splicing site，ss) 具有明显的保守序列 发现的AT-AC型内含子是以AT 双核苷酸起始， AC 双核苷酸结束。后来也发现一部分内含子是以GT起始AG结束的，此外还有极小一小部分内含子边界并不规则。

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