1、外壳保存，菠萝蜜切开后，可以不用全部将果肉取出，可以吃多少取多少，然后剩下的部分就留在外壳上，菠萝蜜的外壳质地坚硬，可以预防脏物的浸染，这种方法适用于春冬季节，不适合夏秋季节。
2、低温保存，低温可以抑制微生物的污染，防止菠萝蜜腐败变质，因此可以将菠萝蜜果肉用密封盒装好后，放入冰箱中保存。
