测序深度是什么意思
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设计简并引物的原则
设计简并引物的原则 2020-11-19 05:05:32
相关问答
什么是测序深度,与基因覆盖度是一回事吗?

深度(Depth):一般用1×、2×、3×……表示。测序的得到的总碱基数与待测基因组大小的比值,即基因组中每个碱基被测到的平均次数,简而言之,测序的数据量比上参考基因组或者转录组的值。覆盖度(Coverage):测序获得...

基因组测序中,什么是测序深度和覆盖度

测序深度是指测序数据对基因组覆盖深度,如人类基因组有3G,我们测了过滤得到cleandata90G数据量,那么测序深度是90/3=30x,覆盖度是,90G数据比对到人类参考基因组上,可以覆盖基因组的比例,如覆盖度80...

测序深度1000x啥意思

测序深度1000x的意思基因组测序的测序深度一般是10X。测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M,测序深度为10X,那么获得的总数据量为20M。基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或...

测序深度的深度指的是什么

测序深度是测序量除以基因组长度,例如测序深度10*就相当于测了10次的全基因组

测序深度和测序覆盖度,怎么估算?

   测序深度(depths)指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值,简单的说就是测序的数据量大小比上参考基因组/转录组的大小,通常结果用n×来表示。   测序覆盖度是...

2021-12-26 测序深度

测序深度(SequencingDepth)相当于测了几遍;指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的比值,其是评价测序量的重要指标之一;测序产生了1000条读段(read),每条读段的长度为50bp,所测物种的基因组大小为10000bp...

高通量基因组测序中,什么是测序深度和覆盖度

简洁版: 深度即:测序得到的总碱基数/基因组碱基数。也可以理解为将基因组测了几遍。测序深度能减少假阳性和测序错误率。覆盖度原来是指基因/转录组上测序测到的部分占整个组的比例,但是现在很多人把coverage也直接当...

覆盖度,测序深度 理解,计算

测序深度是统计落在基因组区域中的总碱基数量,然后除以这个区域的长度。结果一般是1X、5X、10X这样表示。计算coverage和depth结果解读见https://www.jianshu.com/p/ac7b8e4d76e4可关注coverage.report,chrom...

二代测序中的测序深度如100x代表什么意思

测序深度,测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,是评价测序量的指标之一。第二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三...

测序深度

测序得到的碱基总数就是原始的测序数据,其中会包括一些低质量的碱基,通过去除低质量的碱基,再去除片段过短的序列,得到高质量的序列用于后续分析。一般评价测序深度都是用过滤之后高质量的序列来进行评估的,这些序列也将参与...