5月13日，市场监管总局官网发布消息称，根据前期核查，依法对知网涉嫌垄断行为立案调查。知网通过微信公众号发布公告，回应“涉嫌垄断行为被立案调查”，表示将全力支持配合此次调查，将以此次调查为契机，深刻自省，全面自查，彻底整改。

知网在高校市场的占有率为100%，其他主要市场的占有率为60%以上，其毛利率高达53.35%，碾压近9成A股上市公司。此次知网被查，高校师生和网友们纷纷额手称庆。

自2021年底以来知网就在著作权费用、数据库订阅费用和论文查重服务等方面陷入争议。2021年末，中南财经政法大学退休教授赵德馨起诉知网侵权，控诉知网在未经本人授权的情况下，擅自转载其100余篇论文，且从未支付任何稿费，甚至作者下载自己的论文还需要付费。虽然赵德馨胜诉，依法获赔经济损失共计70余万元，但是他和妻子周秀鸾的全部署名论文全部被知网下架。5月12日，知网登门道歉，希望重新上架赵德馨教授夫妇作品。

今年4月，因高昂的续订费用和苛刻的续订条件遭中科院反对，知网曾一度暂停中国科学院对CNKI数据库的使用权限。此外，北京大学、武汉理工大学、南京师范大学等六所高校，也相继因为续订费用上涨幅度较高，宣布停用中国知网。

甚至连钟南山院士关于治疗新冠肺炎的开源免费论文，在知网获取需要付费，但是在知网外文期刊库，可直接跳转至国外数据库开放获取，供读者免费阅读。在主站点上，知网仅显示收费文章，不知情者将会付费下载，给知网带来收益，并且从页面上可以清楚看到，钟南山的文章有一定的被下载次数。