参保户将报销所需资料备齐后交村（社区）合作医疗联络员，由村（社区）合作医疗联络员审核后报镇合作医疗联络员，再由镇联络员送区农易办结报中心进行报销。
农村合作医疗保险的报销，可以参照下列流程进行报销即可。具体如下：
1、新农合参保患者可以凭本人身份证、医保卡，在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。
2、在市外二级及二级以上的公立医疗机构医院住院治疗的参保患者，应在出院后的3个月后，将擦那波人的医药费原始发票、住院医药费用汇总明细清单、出院小结、医疗卡、户口本、门诊病历、经办人身份证直接到新农合窗口报销医药费用。
3、特殊病种门诊报销，参保患者可持二级及二级以上定点医疗机构出具的病历及相关检查报告资料以及《新农合特殊病种门诊治疗审批表》想新农合业管中心提出申请，经过审核批准之后，其门诊医药费用是可以列入到新农合的报销范围内的。
4、因意外伤害住院的话只能和，出院后需要提交意外伤害引发的原因证明和医院的病案记录，对于一些无法提供有效证明和记录的，不予进行受理。参保患者将资料调教之后，新农合窗口受理后的30个工作日内完成，不过，需要经过新农合业管中心稽查人员的调查和审核，情况属实之后才能予以报销。
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