父亲的独立公司股份要转给儿子的，应当签订股份转让协议。父亲要将股份转让给儿子的，应当与儿子签订股份转让协议，签订转让合同后，公司应当注销父亲的出资证明书，同时向儿子签发出资证明书，并且相应的修改公司章程，以及股东名册中有关股东及其出资额的记载，这些内容的修改，应当去公司登记机关办理变更登记。起草股权转让协议并去工商局变更登记即可。
股份，代表对公司的部分拥有权，分为普通股、优先股、未完全兑付的股权。股份一般有以下三层含义：股份是股份有限公司资本的构成成分，股份代表了股份有限公司股东的权利与义务，股份可以通过股票价格的形式表现其价值。
股权，是有限责任公司或者股份有限公司的股东对公司享有的人身和财产权益的一种综合性权利。即股权是股东基于其股东资格而享有的，从公司获得经济利益，并参与公司经营管理的权利。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》第七十三条
依照本法第七十一条、第七十二条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。
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