灵活就业社保和职工社保区别在于：
1、灵活就业社保是个人参保，需要个人进行缴纳，而职工社保则是单位为员工参保，费用由单位和员工共同缴纳，且单位出大头，员工出小头；
2、灵活就业社保只包含了医疗保险和养老保险，而职工社保则包含了医疗保险，养老保险，生育保险，失业保险，工伤保险；
3、灵活就业社保参保人员只要满足一定条件，还能获得灵活就业人员社保补贴等。
灵活就业缴纳的社保和职工社保不同主要体现在以下几点：
第一，险种不同，职工社保就是我们常说的五险，包含养老，工伤，失业，医疗和生育，近年来，医疗和生育已经合并，而灵活就业人员缴纳的一般只有养老和医疗。大部分地区灵活就业者是无法参加生育和失业保险的，只有少数地区可以参加失业险。
另外单位就业的劳动者参加社保是强制性的，当单位没有缴纳社保的时候，劳动者可以依法维权，要求单位补缴社保。而灵活就业人员等群体是无法通过事后追补缴费的方式增加缴费年限的。
第二，缴费性质不同，根据《社保法》的规定，用人单位和劳动者必须参加社会保险，如果存在合法劳动关系但是单位没有按照规定给员工缴纳城镇职工社保，那么属于违法行为。而灵活就业者缴纳社保没有强制性，是自愿原则，灵活就业人员可自由选择是否参保。
第三，缴费的主体不一样，单位缴纳社保，职工养老保险的单位缴费比例为缴费基数的16%，职工个人缴费比例为8%，也就是单位会承担大部分费用，职工个人只需要承担一小部分，而灵活就业人员自己缴纳社保，需要自己负担全部费用，相对来说，灵活就业缴纳的负担会重一点。
第四，缴费的基数不一样，单位交社保，缴费基数是根据职工本人上年度的平均工资计算的，而自己以灵活就业人员身份交社保，可以根据自身实际情况选择适合自己的缴费基数，缴费基数范围通常为当地上年度社会平均工资的60%-300%。
第五，待遇政策不一样，灵活就业人员参加社保和职工参加社保在待遇上会有一点区别，比如说，就业困难人员社会保险补贴，单位招聘就业困难人员，相应的补贴是发给公司的，而灵活就业人员就是补给个人的，而去两者的比例也是不同的。
第六，退休的时间不一样，按照现在退休时间规定，单位缴纳社保，男性60周岁退休，女工人50周岁退休，女干部55周岁退休，灵活就业者自己缴纳社保，男性60周岁退休，女性55周岁退休，当然也有部分地区允许女性灵活就业者50周岁退休，具体以当地政策为准。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
