分居两年的起诉流程如下：1、原告向人民法院递交起诉书、副本及相关的证据；2、人民法院接受原告提交的文件、材料，进行审查；3、经审查起诉符合法律规定、要求，作出受理决定并立案。4、人民法院决定立案之日起五日内将原告的起诉书副本送达被告，并告知被告作出书面答辩；5、被告自收到人民法院送达的起诉书副本之日起十五日内作出书面答辩。6、法庭调查；7、法庭辩论；8、法官主持调解；9、调解无效、判决。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十条、一百二十二条、一百二十三条、一百二十五条、一百四十八条
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