微信深度清理中的文件可以清除，如果微信里面没有什么重要文件，清除数据没什么影响。建议深度清理之前检查一下重要文件是否保存，然后再进行清理。
微信清除数据会将微信里面所有文件（群文件，但收藏里面的内容不会被清除）、设置、账号(清除数据后需要重新登录）、数据库等都清除。聊天记录会被清除。个人发的朋友圈不会被清除。
微信中平时发的表情包、图片、视频（自己拍的视频、朋友圈小视频）、文档等使得微信所占手机内存很大。因此，微信占据手机的空间越来越大主要是因为手机软件除了存储缓存以外，还会存储数据。缓存包括软件在使用过程中存储的一些临时数据，如：图片、视频、网页等；数据包括软件在运行过程中产生的一些固定信息，如：个人登录的信息，进度保存信息、设置信息等。
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