工程施工会计科目下面设置“合同成本”和“毛利”两个二级明细科目，账务处理如下：实际发生的合同成本；已结算的工程价款；已收的工程价款；确认的收入、费用和毛利；主营业务成本；工程完工时，将“工程施工”科目的余额与“工程结算”科目的余额对冲。