你问的是力场吧,力场有很多 Amber OPLS COMPASS 等等
从MM2开始,二面角扭曲势增加了至关重要的三项,为分子动力学模拟提供了更深入的理解。MM3则引入了离面弯曲和MM4的赝扭曲,进一步丰富了力场的精细描述。键伸缩和键角弯曲势函数的扩展,使MMn能够适应各种复杂的分子结构,如...
uff力场可以计算元素周期表上所有的元素,Dreiding力场适用于有机小分子,大分子,主族元素的计算
在反应力场下,两个group之间的作用力可以使用分子动力学模拟计算。分子动力学模拟是一种计算物质分子运动和相互作用的方法,可以模拟分子之间的相互作用力和动力学行为。通常,分子动力学模拟需要使用分子力场和基于牛顿力学的方程...
分子力场有很多,比如生物模拟常用的AMBER, CHARMM, OPLS, GROMOS,材料领域常用的CFF, MMFF, COMPASS等等。他们的区别在哪里呢?一个力场通常包括三个部分:原子类型,势函数,和力场参数。也就是说不同的力场,他们的函数...
MD是一种基于牛顿力学确定论的热力学计算方法,与蒙特卡洛法相比在宏观性质计算上具有更高的准确度和有效性,可以广泛应用于物理,化学,生物,材料,医学等各个领域。但是MD没有考虑电子转移效应,不能准确模拟化学成键;需要...
运用昂萨格的衡态热力学理论,可以得到体系的一些动力学性质,例如扩散系数、粘度、导热系数等等。用从头算的动力学模拟可以全面模拟微观反应性,例如分子的电荷密度分布、催化剂表面的催化性能、化学键的动态强度、电子或轨道...
进行分子动力学模拟的第一步是确定起始构型,一个能量较低的起始构型是进行分子模拟的基础 ,一般分子的起始构型主要来自实验数据或量子化学计算.在确定起始构型之后要赋予构成分子的各个原子速度,这一速度是根据玻尔兹曼分布随机...
说起分子动力学,不得不提到分子模拟(Molecular Simulation),分子模拟是二十世纪下半叶发展起来而如今最为热门的一种计算机模拟方法。随着量子力学理论的逐步完善、经验力场的不断开发和更新换代以及计算机的普及和计算速度和...
在分子动力学模拟中,经验场可以指代力场(force field),它是一种描述分子间相互作用的经验表达式,用于计算分子的运动和相互作用。力场通常基于实验数据和理论模型,用于模拟分子的结构、动力学和热力学性质。