预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数，基因组序列分析等。由于多序列比对能够揭示双序列比对所不能发现的序列微弱相似性、序列模式和功能位点，因而对蛋白质和核酸序列的结构、功能和进化研究更加有用。1...

按比对序列条数分类双序列比对:两条序列的比对多序列比对:三条或以上序列的比对1.相似的序列可能具有相似的功能与结构2.发现一个基因或蛋白哪些区域容易发生突变，哪些位点突变后对功能没有影响3.发现生物...

目前,构建多序列比对模型的方法大体可以分为以下三类：手工比对方法手工比对方法在文献中经常看到。因为难免加入一些主观因素，手工比对通常被认为有很大的随意性。其实，即使用计算机程序进行自动比对，所得结果中的片面性也不能...

双重序列比对:双序列比对是指对两条序列M和N进行比对,找到其相似性关系,这种寻找生物序列相似性关系的过程被称为双序列比对。其算法可以主要分成基于全局比对的Needleman-Wunsch算法和基于局部比对的Smith-Waterman局部比对算法多重序列比对:...

3、多序列比对：常用的软件为:mafft,muscle,clusta-omega,t-coffee等，是全局比对。4、BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)，结果是局部比对。Itspurposeistosearchalargebodyofknowninformation...

1、序列比对：序列比对是一种比较两个DNA或RNA序列的方法，可以用于找出两组碱基之间的异同。常用的比对软件包括BLAST、Clustal等。通过比对不同组的碱基序列，可以找到它们之间的同源性，以及具体的差异。这种方法适用于对两个...

1、比对长度：短序列比对用于比对短的DNA或RNA序列，如PCR产物、小RNA等。这些序列长度在几十到几百个碱基对之间。而常规的序列比对用于比对长的DNA或RNA序列，如基因组、转录组等。这些序列长度在几百万到数十亿个碱基对...

如果你对于结果没有什么预期，例如只是为了单纯地比较两个不同的序列，则可以使用默认的罚分参数，即gapopen=10,gapextend=0.5。局部比对提供了三种算法选择最经典的Simith-Waterman算法其他所有的步骤都和...

一般来说，是输入一组假定拥有演化关系的序列。多重序列比对(Multiplesequencealignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biologicalsequence)，如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对。一般来说，是输入一组假定拥有...

（2）局部序列比对：局部比对的目标是寻找两序列最优比对区（子序列），不需要延伸到序列的两端；局部比对是数据库搜索是最常用的算法，在寻找序列之间的结构域时相当有用。1）Smith-Waterman算法1.设置一个矩阵，大小...