一、分居三年是否可以申请离婚
1、分居三年可以申请离婚，夫妻双方自愿离婚的，可以协议离婚，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记;夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
2、法律依据：《中华人民共和国民法典》
第一千零七十六条，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第一千零七十八条，婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。
第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
二、证明夫妻分居的常见证据有哪些
1、一方在外居住的房屋租赁合同;
2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认;
3、一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间;
4、双方来往的书信、电子邮件等
能证明双方感情不和分居的事实;
5、人证也可以，比如双方都认识的朋友或者亲戚，不过因为证人往往和为其作证的一方有利害关系，以及分居是夫妻“私事”，所以单独的证人证言难为法院采信，要辅佐以其他的证据。
这里需要特别提醒一点：因为分居为夫妻之间的私事，外部的证据的证明力十分有限。因此即使有上述证据，法院也未必一定会采纳。因此，对于那些试图通过“因感情不和分居满两年”而离婚的人，如果还没有分居，最好还是放弃，而转为直接起诉离婚，法院判决不准离婚六个月以后，再次提起离婚诉讼，这时法院通常会判决离婚。这样要比苦苦等待两年要快多了，而且成功率还高。
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