希望对大家有所帮助。
一、住院农村合作医疗报销流程
第一：住院的时候提供新农村医疗保险卡。医院会登记在册，你正常办理住院手续，入住医院治疗即可。
第二：所有缴费凭证均要留下。不论是办理入住医院时以及在住院产生的各项费用，凭证均要留在手里，千万不要丢。
第三：出院的时候找结费窗口办理医疗保险报销等手续。在你出院的时候，去窗口询问医疗保险报销事宜。
附：
现在医院都可以走医疗保险，医疗保险系统直接跟医院连在一起了，你可以直接办理，偶尔有时候，医保系统有问题，医院会让你过几天办理的。
相关资料走完以后，他会通知你什么时候来领取报销费用，其实医疗保险费用，不是住院所有的费用都可以报销的，他是分好多种的，有些是不可以报销的，按正常来说，应该大体上能报下来所花费用的一半。
二、农村合作医疗的报销补偿
门诊补偿
村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
中药发票附上处方每贴限额1元。
镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
住院补偿
报销范围：
A、药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费，限额200元；手术费（参照国家标准，超过1000元的按1000元报销）。
B、60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
报销比例：镇卫生院报销60%；二级医院报销40%；三级医院报销30%。
大病补偿
镇风险基金补偿：凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。
镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1.1万元。
新型农村合作医疗基金报销支付特殊病种有：恶性肿瘤化疗、放疗；重症尿毒症的血透和腹透；组织或器官移植后的抗排异反应治疗；精神分裂症伴精神衰退；系统性红斑狼疮（有心、肺、肾、肝及神经系统并发症之一者）；再生障碍性贫血；心脏手术后抗凝治疗。其余可报销的特殊病种，以当地具体政策为准。
特殊病种的特定门诊治疗包括治疗期间必须的支持疗法和全身、局部反应对症处理，一般辅助治疗不列入报销范围。
《中华人民共和国社会保险法》第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。 《中华人民共和国社会保险法》第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。 《中华人民共和国社会保险法》第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。 社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
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