法律分析：首先，国庆节法定假日只有三天，就是10月1日、10月2日、10月3日这三天，其它日期是企业自由安排和串休的。即使说不扣除，也只能是这三天的工资不扣除。

其次，要看你公司执行的是哪种工时制度，根据中华人民共和国《工资支付暂行规定》第13条，如果公司执行“综合工时制”或者“不定时工时制”，那么公司是可以未在法定假期间安排员工工作为由，不支付法定假工资的。

最后，建议你调查清楚公司的薪酬制度和工时制度，如确实少付了工资，你可以向劳动保障部门申请仲裁的。