法律分析：当然是职能不同。法院：核心职能是审判（当然还有执行），一般分为立案庭、刑事审判庭、民事审判庭、行政审判庭等、其他业务还有立案和执行等，以及诸如政工办，办公室，后勤等行政部门。检察院：核心职能分两块：一是刑事案件的审查逮捕、审查起诉；二是职务犯罪案件的侦查。此外还有控告申诉、民事行政检察、监狱看守所检察监督等，以及行政部门。

法律依据：《中华人民共和国人民法院组织法》 第三十三条 合议庭审理案件，法官对案件的事实认定和法律适用负责；法官独任审理案件，独任法官对案件的事实认定和法律适用负责。人民法院应当加强内部监督，审判活动有违法情形的，应当及时调查核实，并根据违法情形依法处理。