施工合同在在政府有建设主管部门来办理备案处理，根据《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第四十七条规定：订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。施工合同备案方法包括：承包人登陆政府门户网站，在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，在对应的合同备案表中填写信息打印；办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
招标人可以根据招标工程的需要，对投标申请人进行资格预审，也可以委托工程招标代理机构对投标申请人进行资格预审。实行资格预审的招标工程，招标人应当在招标公告或者投标邀请书中载明资格预审的条件和获取资格预审文件的办法。资格预审文件一般应当包括资格预审申请书格式、申请人须知，以及需要投标申请人提供的企业资质、业绩、技术装备、财务状况和拟派出的项目经理与主要技术人员的简历、业绩等证明材料。
一、施工合同主体审查的内容
1、承包人应注意审查发包人资质。
对发包方主要应了解两方面内容：
①主体资格，即建设相关手续是否齐全。例：建设用地是否已经批准？是否列入投资计划？规划、设计是否得到批准？是否进行了招标等；
②发包人如果是属于分包人，审查其是否具有分包资格；
③履约能力即资金问题。发包人的实力、已完成的工程、市场信誉度、施工所需资金是否已经落实或可能落实等。
2、发包人应注意审查承包人资质。
①承包人一般应为建筑企业法人，除了内部承包之外，公民个人不能成为建设工程合同的主体；
②承包人应具有承包建设工程的资质。
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